Sau khi uống, naproxen được hấp thu hoàn toàn (95-100%). Liên quan đến lượng thức ăn, sự hấp thụ chậm lại nhưng khả dụng sinh học vẫn không bị ảnh hưởng. Sau khi dùng một liều duy nhất 250 mg (25 mg/mL, 10 mL) cho người lớn khỏe mạnh, nồng độ đỉnh trong huyết tương đạt được trong 1 đến 1,5 giờ và nồng độ đỉnh khoảng 50 µg/mL. Nồng độ điều trị trong huyết tương được coi là 30-90 µg/mL. Liên kết với protein huyết tương của naproxen rất rộng (> 99%); nó liên kết chủ yếu với albumin mà còn với globulin, và thể tích phân phối của nó là khoảng 0,15 L/kg. Tổng nồng độ naproxen trong dịch khớp bằng 65-70% so với trong huyết tương, trong khi nồng độ naproxen không liên kết là như nhau. Naproxen có dược động học tuyến tính với liều duy nhất lên đến 500 mg. Ở liều cao hơn mức này, liên kết với protein huyết tương được bão hòa, nồng độ của naproxen không liên kết tăng lên và quá trình đào thải được đẩy nhanh.
Thời gian bán thải trong huyết tương là 12-15 giờ và trong dịch khớp lên đến 30 giờ.
Naproxen được thải trừ trong gan (CYP450 isoenzym 1A2, 2C8 và 2C9) thành 6-O-demethylnaproxen không hoạt động về mặt dược lý. Naproxen và 6-O-demethylnaproxen được bài tiết chủ yếu qua nước tiểu dưới dạng liên hợp sulphat và glucuronid. Tuần hoàn ruột dường như tồn tại nhưng mức độ của nó không được biết đến. Chỉ 1-2% tổng liều được thải trừ qua phân. Dược động học của naproxen ở trẻ em và người lớn là như nhau trong khi ở người cao tuổi, nồng độ naproxen không liên kết trong huyết tương cao hơn và thải trừ chậm hơn. Naproxen không được tích lũy ở một mức độ đáng kể liên quan đến suy thận. Naproxen không thể thẩm tách được. Nếu độ thanh thải creatinin dưới 10 mL/phút, 6-O-demethylnaproxen được tích lũy nhưng nó có thể được loại bỏ trong thẩm tách máu. Liên quan đến suy gan, quá trình đào thải naproxen bị chậm lại, và nếu nồng độ albumin huyết tương giảm, nồng độ naproxen không liên kết trong huyết tương sẽ tăng lên.